艾灸适合治疗的是一些寒性、虚性的疾病，主要以慢性疾病为主。基本上可以把这些疾病分为几类：

关节性疾病：包括老年人退行性关节炎、关节活动障碍、肩周炎、腰椎病、颈椎病等;办公室白领因工作性质导致的腰椎病、颈椎病需要经过医生辨证之后，才可判断是否适合艾灸。证型属于肝阳上亢型的关节性疾病是不适宜艾灸的。

消化系统疾病：包括十二指肠溃疡、慢性胃炎、慢性结肠炎、胃肠功能障碍等疾病;另外就是辨证为虚寒型的拉肚子、胃胀、胃痛，也可通过艾灸治疗。

杂病：例如一些常见的妇科、男科疾病，慢性盆腔炎、前列腺炎等。还有一些属于虚寒型的症状如小便清长、腰膝酸软、下腹坠胀等也属于艾灸的治疗范围。

顽固性疾病：包括强直性脊柱炎，一些通过中医的辨证，属于虚寒性的诊断不明，没有办法解释的功能性疾病。专家这样解释到，艾灸治疗疾病是从辨证论治的角度出发的，即便是同一个疾病，选取的穴位也可能有所不同，所以要严格根据疾病来分艾灸穴位的话，比较难。但是可以根据疾病类型选取一些通用的穴位，来达到保健和防治的作用。

保健选穴：儿童方面多见的是腹泻、腹胀等消化系统的疾病或者是感冒、咳嗽等呼吸系统的疾病，所以以保健来论，艾灸选穴建议选取：大椎、肺俞、足三里、大肠俞等。

老人方面多见是一些虚寒类的疾病如关节退行性病、局部肌肉关节疼痛等。艾灸选穴建议以滋养肝肾，提升阳气为主，建议选取：命门、百会、足三里及阿是穴。妇科、男科保健方面建议可以选取腹部和腰骶部的一些保健穴位，女性还可以选取子宫一穴作为日常保健。手脚冰凉的人群可以选取大椎、关元、足三里及四肢末端的一些穴位来减轻手脚冰凉的症状。补肾、补脾可以选择肾俞、脾俞、命门。

疾病选穴：消化性疾病、女性的子宫下垂、头晕可以选择百会穴治疗。

失眠：通过辨证非阴虚、热证之后可以选择百会、风池、三阴交及足三里治疗。

颈椎病、颈部疼痛可以选择风池、大椎、督脉和膀胱经上的一些穴位来治疗。

肩部疼痛可以选择肩髎、肩髃、手臂等穴位。